孤对电子是指分子中除了用于形成共价键的键合电子外，在原子最外电子层中还经常存在未用于形成共价键的非键合电子。这些未成键的价电子对叫做孤对电子。
所谓“孤”是因为未成键，而“对”是因为两个自旋相反的电子会配对。孤对电子是分子或离子未共享价层的电子对。孤对电子在分子中的存在和分配影响分子的形状、偶极矩、键长、键能等，对轻原子组成的分子影响尤为显著。路易斯碱的碱性，配体通过配位原子与中心体的键合，亲核反应的发生等均通过孤对电子。
关于孤对电子和空轨道
1、空轨道就是没有被电子占据的轨道，应该说所有的离子或原子都有空轨道，只不过这些空轨道有时候能被电子填充，有些则永远不会被填充。比如氢原子的第二层轨道都空着，但是从未见被填充过。而锌离子的第四层轨道都空着，就经常被填充。
2、孤对电子是价键理论中的概念，就是已经成对但是没有成键的电子，比如氨气分子中，氮原子的第二电子层就有一对孤对电子，其中的两个电子，杂化后就跑到杂化轨道上了，但仍然是孤对电子，但是铵离子中，这一对孤对电子也与氢离子成键了，就不能叫孤对电子了。
