总公司可以撤销分公司的起诉。《中华人民共和国公司法》第十四条规定，分公司不具有法人资格，其民事责任由公司承担。所以分公司向人民法院提起诉讼的，这个诉讼行为应当由总公司进行，因此总公司是可以撤回起诉的。
分公司能否代表总公司起诉
根据《民事诉讼法》第49条的规定，法人依法设立并领取营业执照的分支机构可以作为独立的民事诉讼主体。根据《公司法》第l4条规定，有限责任公司可以设立分公司，分公司不具有法人资格，其民事责任由公司承担。
总公司给分公司拨款怎么入账
总公司拨款会计分录：
(1)总公司会计分录
借：其他应收款——分公司
贷：银行存款等
(2)分公司会计分录
借：银行存款等
贷：其他应付款——总公司
对公账户进出账不需要缴税，缴税是按收入的比例来缴纳的，但实际上很多企业是按发票金额缴税的。所以如果税局来查对公账户的进出账时，发现银行往来资料里存在不开票未缴税的收入信息时，就需要补缴税和缴纳罚款了，所以企业必须保证每笔进出款都要有依有据。
分公司不注销总公司可以注销吗
分公司不注销总公司不可以注销，因为注销总公司都先要注销分公司，只注销总公司须将分公司变成独立法人。分公司的营业执照不吊销，意味着其仍然可以继续经营，所产生的不良后果将直接影响到总公司的利益。
